| | 研究疾患名 | 研究班名簿 | 疾患概要 |
| 1 | 遺伝性ポルフィリン症 | 名簿 | | 概要 | |
| 2 | 遺伝性高チロシン血症 | 名簿 | | Ⅰ型概要 Ⅱ型概要 Ⅲ型概要 | |
| 3 | 遺伝性出血性末梢血管拡張症(オスラー病) | 名簿 | | 概要 | |
| 4 | 遺伝性女性化乳房 | 名簿 | | 概要 | |
| 5 | 遺伝性多発性外骨腫症 | 名簿 | | 概要 | |
| 6 | 遺伝性鉄芽球性貧血 | 名簿 | | 概要 | |
| 7 | 遺伝性脳小血管病 | 名簿 | | 概要 | |
| 8 | 遺伝性不整脈 | 名簿 | | 概要 | |
| 9 | 一過性骨髄異常増殖症 | 名簿 | | 概要 | |
| 10 | 遠位型ミオパチー | 名簿 | | 概要 | |
| 11 | 家族性寒冷自己炎症性症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 12 | 家族性血小板異常症 | 名簿 | | 概要 | |
| 13 | 家族性地中海熱 | 名簿 | | 概要 | |
| 14 | 家族性良性慢性天疱瘡(Hailey-Hailey病) | 名簿 | | 概要 | |
| 15 | 歌舞伎症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 16 | 過剰運動(hypermobility)症候群類縁疾患 | 名簿 | | 概要 | |
| 17 | 外リンパ瘻 | 名簿 | | 概要 | |
| 18 | 外胚葉形成不全免疫不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 19 | 褐色細胞腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 20 | 肝型糖原病 | 名簿 | | 概要 | |
| 21 | 急激退行症(21トリソミーに伴う) | 名簿 | | 概要 | |
| 22 | 急性大動脈症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 23 | 筋チャネル病 | 名簿 | | 概要 | |
| 24 | 筋強直性ジストロフィー(筋緊張性ジストロフィー) | 名簿 | | 概要 | |
| 25 | 筋型糖原病 | 名簿 | | 概要 | |
| 26 | 劇症1型糖尿病 | 名簿 名簿 | | 概要 概要 | |
| 27 | 血管新生黄斑症 | 名簿 | | 概要 | |
| 28 | 血球貪食症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 29 | 原発性リンパ浮腫 | 名簿 名簿 名簿 | | 概要 概要 概要 | |
| 30 | 原発性局所多汗症 | 名簿 | | 概要 | |
| 31 | 後天性血友病ⅩⅢ | 名簿 | | 概要 | |
| 32 | 好酸球性食道炎・好酸球性胃腸炎 | 名簿 名簿 | | 概要 概要 概要 | |
| 33 | 好酸球性膿疱性毛包炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 34 | 好酸球性副鼻腔炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 35 | 孔脳症 | 名簿 | | 概要 | |
| 36 | 高IgD症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 37 | 高カルシウム尿症と腎石灰化を伴う家族性低マグネシウム血症 | 名簿 | | 概要 | |
| 38 | 高グリシン血症 | 名簿 | | 概要 | |
| 39 | 膠様滴状角膜変性症 | 名簿 | | 概要 | |
| 40 | 骨形成不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 41 | 骨系統疾患におけるCNP治療適応疾患 | 名簿 | | 概要 | |
| 42 | 再発性多発軟骨炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 43 | 細網異形成症症 | 名簿 | | 概要 | |
| 44 | 自己貪食空胞性ミオパチー | 名簿 | | 概要 | |
| 45 | 若年性特発性関節炎 (全身型) | 名簿 | | 概要 | |
| 46 | 周産期の難聴(先天性難聴) | 名簿 | | 概要 | |
| 47 | 周産期心筋症(産褥心筋症) | 名簿 | | 概要 | |
| 48 | 重症・難治性急性脳症 | 名簿 | | 概要 | |
| 49 | 小眼球(症) | 名簿 | | 概要 | |
| 50 | 小児慢性腎臓病 | 名簿 | | 概要 | |
| 51 | 症候性頭蓋縫合早期癒合症(クルーゾン/アペール/ファイファー/アントレー・ビクスラー症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 52 | 新生児、乳児食物蛋白誘発胃腸炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 53 | 新生児・乳児巨大肝血管腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 54 | 新生児一過性糖尿病・新生児糖尿病 | 名簿 名簿 | | 概要 概要 | |
| 55 | 進行性下顎頭吸収 | 名簿 | | 概要 | |
| 56 | 進行性心臓伝導障害 | 名簿 | | 概要 | |
| 57 | 腎性低尿酸血症 | 名簿 | | 概要 | |
| 58 | 腎性尿崩症 | 名簿 | | 概要 | |
| 59 | 瀬川病 | 名簿 名簿 | | 概要 概要 | |
| 60 | 性分化疾患 | 名簿 | | 概要 | |
| 61 | 脆弱X症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 62 | 脊髄障害性疼痛症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 63 | 脊柱変形疾患に合併した胸郭不全症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 64 | 先天性QT延長症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 65 | 先天性横軸形成障害(上腕欠損、前腕欠損) | 名簿 | | 概要 | |
| 66 | 先天性角化不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 67 | 先天性及び後天性の難治性白斑・白皮症 | 名簿 | | 概要 | |
| 68 | 先天性筋無力症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 69 | 先天性好中球減少症 | 名簿 | | 概要 | |
| 70 | 先天性高インスリン血症 | 名簿 | | 概要 | |
| 71 | 先天性赤芽球癆 (Diamond Blackfan貧血) | 名簿 | | 概要 | |
| 72 | 先天性大脳白質形成不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 73 | 先天性無痛症(HSAN4型、5型) | 名簿 | | 概要 | |
| 74 | 先天性顆粒放出異常 | 名簿 | | 概要 | |
| 75 | 先天白内障 | 名簿 | | 概要 | |
| 76 | 全身性炎症肉芽腫性疾患(ブラウ症候群/若年発症サルコイドーシス) | 名簿 | | 概要 | |
| 77 | 早期再分極(early repolarization)症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 78 | 早期発症型侵襲性歯周炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 79 | 鰓弓耳腎症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 80 | 総排泄管残存症 | 名簿 | | 概要 | |
| 81 | 多発肝のう胞症 | 名簿 | | 概要 | |
| 82 | 多発性内分泌腫瘍症 | 名簿 | | 概要 | |
| 83 | 胎児仙尾部奇形腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 84 | 単純性潰瘍/非特異性多発性小腸潰瘍症 | 名簿 | | 概要 | |
| 85 | 胆道閉鎖症、新生児乳児胆汁うっ滞症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 86 | 弾性線維性仮性黄色腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 87 | 致死性骨異形成症 | 名簿 | | 概要 | |
| 88 | 中性脂肪蓄積心筋血管症 | 名簿 | | 概要 | |
| 89 | 中條-西村症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 90 | 長鎖脂肪酸代謝異常症 | 名簿 | | 概要 | |
| 91 | 低フォスファターゼ症 | 名簿 | | 概要 | |
| 92 | 道化師様魚鱗癬 | 名簿 | | 概要 | |
| 93 | 特発性角膜内皮炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 94 | 特発性周辺部角膜潰瘍 | 名簿 | | 概要 | |
| 95 | 那須ハコラ病 | 名簿 | | 概要 | |
| 96 | 内臓錯位症候群 | 名簿 名簿 | | 概要 概要 | |
| 97 | 軟骨無形成症 | 名簿 | | 概要 | |
| 98 | 難治性(特発性)慢性好酸球性肺炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 99 | 難治性血管腫・血管奇形(混合血管奇形など) | 名簿 | | 概要 | |
| 100 | 難治性川崎病 | 名簿 | | 概要 | |
| 101 | 難治性間質性膀胱炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 102 | 難治性脳形成障害症 | 名簿 | | 概要 | |
| 103 | 難治性不育症 | 名簿 | | 概要 | |
| 104 | 難治性慢性痒疹・皮膚そう痒症 | 名簿 | | 概要 | |
| 105 | 難治性類天疱瘡 | 名簿 | | 概要 | |
| 106 | 難治頻回部分発作重積型急性脳炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 107 | 乳児ランゲルハンス細胞組織球症 | 名簿 | | 概要 | |
| 108 | 乳児期QT延長症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 109 | 乳児特発性僧帽弁腱索断裂 | 名簿 | | 概要 | |
| 110 | 破局てんかん | 名簿 | | 概要 | |
| 111 | 肺静脈閉塞症 | 名簿 | | 概要 | |
| 112 | 肺胞蛋白症 | 名簿 | | 概要 | |
| 113 | 反復胞状奇胎 | 名簿 | | 概要 | |
| 114 | 肥厚性硬膜炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 115 | 肥厚性皮膚骨膜症 | 名簿 | | 概要 | |
| 116 | 非もやもや病小児閉塞性脳血管障害 | 名簿 | | 概要 | |
| 117 | 封入体筋炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 118 | 分類不能型免疫不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 119 | 芳香族アミノ酸脱炭酸酵素欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 120 | 慢性活動性EBウイルス感染症 | 名簿 | | 概要 | |
| 121 | 慢性偽性腸閉塞症 | 名簿 | | 概要 | |
| 122 | 牟婁病(紀伊ALS/PDC) | 名簿 | | 概要 | |
| 123 | 毛細血管拡張性小脳失調症 | 名簿 | | 概要 | |
| 124 | 優性遺伝形式を取る遺伝性難聴 | 名簿 | | 概要 | |
| 125 | 両側小耳症・外耳道閉鎖症(両側伝音難聴) | 名簿 | | 概要 | |
| 126 | 両側性蝸牛神経形成不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 127 | アトピー性脊髄炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 128 | アラジール(Alagille)症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 129 | アレキサンダー病 | 名簿 | | 概要 | |
| 130 | アンジェルマン症候群(AS) | 名簿 | | 概要 | |
| 131 | インターロイキン1受容体関連キナーゼ4(IRAK4)欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 132 | ウエルナー(Werner)症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 133 | ウォルフヒルシュホーン症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 134 | ウルリッヒ病(Ullrich disease) | 名簿 | | 概要 | |
| 135 | エーラスダンロス症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 136 | エマヌエル症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 137 | オカルト黄斑ジストロフィー | 名簿 | | 概要 | |
| 138 | オピッツ三角頭蓋症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 139 | オルニチントランスカルバミラーゼ欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 140 | カルバミルリン酸合成酵素I欠損 | 名簿 | | 概要 | |
| 141 | コケイン症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 142 | コステロ症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 143 | コハク酸セミアルデヒド脱水素酵素欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 144 | サクシニル-CoA:3-ケト酸CoAトランスフェラーゼ欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 145 | サラセミア | 名簿 | | 概要 | |
| 146 | ジストニア | 名簿 名簿 | | 概要 概要 | |
| 147 | シトリン欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 148 | ステロイド依存性感音難聴 | 名簿 | | 概要 | |
| 149 | セピアプテリン還元酵素欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 150 | ソトス症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 151 | チロシン水酸化酵素欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 152 | トゥレット症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 153 | ヌーナン症候群(Noonan症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 154 | バルデー・ビードル症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 155 | ビオチン代謝異常症 | 名簿 | | 概要 | |
| 156 | ビッカースタッフ型脳幹脳炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 157 | ファ-ル病(特発性両側性大脳基底核・小脳歯状核石灰化症) | 名簿 | | 概要 | |
| 158 | フックス角膜内皮変性症 | 名簿 名簿 | | 概要 概要 | |
| 159 | プラダー・ウイリー症候群 | 名簿 名簿 | | 概要 概要 | |
| 160 | プロピオン酸血症(プロピオン酸尿症) | 名簿 名簿 | | 概要 概要 | |
| 161 | ベスレムミオパチー | 名簿 | | 概要 | |
| 162 | ヘモクロマトーシス | 名簿 | | 概要 | |
| 163 | ペルーシド角膜辺縁変性 | 名簿 | | 概要 | |
| 164 | マリネスコ-シェーグレン症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 165 | マルファン症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 166 | ミクリッツ病 | 名簿 | | 概要 | |
| 167 | ミトコンドリアHMG-CoA合成酵素欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 168 | メチルマロン酸血症(メチルマロン酸尿症) | 名簿 | | 概要 | |
| 169 | ヤング・シンプソン症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 170 | リジン尿性蛋白不耐症 | 名簿 | | 概要 | |
| 171 | リンパ管腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 172 | レリーワイル症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 173 | ロイス・デイーツ症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 174 | Aicardi-Goutières (エカルディ-グティエール) 症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 175 | Aicardi症候群 (アイカルディ症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 176 | ATR-X(X連鎖αサラセミア・精神遅滞)症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 177 | Beckwith-Wiedemann症候群 (ベックウィズ-ヴィーデマン症候群) | 名簿 名簿 | | 概要 概要 | |
| 178 | Bloom症候群(ブルーム症候群)・ Rothmund-Thomson症候群 (ロスムンド・トムソン症候群) | 名簿 | | 概要 概要 | |
| 179 | Brugada症候群 (ブルガダ症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 180 | Calciphylaxis (カルシフィラキシス) | 名簿 | | 概要 | |
| 181 | Carney複合 (カーニー複合) | 名簿 | | 概要 | |
| 182 | CFC症候群 (シー・エフ・シー症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 183 | Charcot-Marie-Tooth病 (シャルコー・マリー・トゥース病) | 名簿 | | 概要 | |
| 184 | CHARGE症候群 (チャージ症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 185 | CINCA症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 186 | Congenital dyserythropoietic anemia (CDA) | 名簿 | | 概要 | |
| 187 | EEC症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 188 | Ellis-van Creveld症候群 (エリス・ファンクレフェルト症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 189 | Galloway-Mowat 症候群 (ギャロウェイ-モワト症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 190 | Gorlin症候群 (ゴーリン症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 191 | HMG-CoAリアーゼ欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 192 | IgG4関連全身硬化性疾患 | 名簿 | | 概要 | |
| 193 | IgG4関連多臓器リンパ増殖性疾患 | 名簿 | | 概要 | |
| 194 | Menkes病・occipital horn症候群 (メンケス病、オクチピタル・ホーン症候群) | 名簿 | | 概要 概要 | |
| 195 | Microscopic colitis | 名簿 | | 概要 | |
| 196 | MODY1-6(家族性若年糖尿病) | 名簿 | | 概要 | |
| 197 | Mowat-Wilson症候群 (モワット・ウィルソン症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 198 | Muckle-Wells症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 199 | Pelizaeus-Merzbacher病 (ペリツェウス・メルツバッハー病) | 名簿 | | 概要 | |
| 200 | Pendred症候群(ペンドレッド症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 201 | Perry(ペリー)症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 202 | Rett症候群 (レット症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 203 | Rubinstein-Taybi症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 204 | Shwachman-Diamond症候群 (シュバッハマン・ダイアモンド症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 205 | Silver-Russell症候群 (シルバーラッセル症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 206 | TNF受容体関連周期性症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 207 | Usher症候群 (アッシャー症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 208 | VATER症候群 (ヴァーター症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 209 | von Hippel-Lindau 病 (フォン・ヒッペルリンドウ病) | 名簿 | | 概要 | |
| 210 | Wolfram症候群 (ウォルフラム症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 211 | β-ケトチオラーゼ欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 212 | 14番染色体父親性関連疾患(upd(14)pat)、14番染色体母親性関連疾患(upd(14)mat) | 名簿 | | 概要1 概要2 | |
| 213 | 1番染色体短腕末端部分欠失症候群(1p36欠失症候群) | 名簿 | | 概要 | |
| 214 | 22q11.2欠失症候群 | 名簿 | | 概要 | |