| | 研究疾患名 | 研究班名簿 | 疾患概要 |
| 1 | 遺伝性ポルフィリン症 | 名簿 | | 概要 | |
| 2 | 遺伝性出血性末梢血管拡張症(オスラー病) | 名簿 | | 概要 | |
| 3 | 遺伝性鉄芽球性貧血 | 名簿 | | 概要 | |
| 4 | 遺伝性脳小血管病(CADASIL、CARASIL) | 名簿 | | 概要 | |
| 5 | 一過性骨髄異常増殖症 | 名簿 | | 概要 | |
| 6 | 円錐角膜 | 名簿 | | 概要 | |
| 7 | 遠位型ミオパチー | 名簿 | | 概要 | |
| 8 | 家族性寒冷蕁麻疹(FCAS) | 名簿 | | 概要 | |
| 9 | 家族性地中海熱 | 名簿 | | 概要 | |
| 10 | 歌舞伎症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 11 | 外リンパ瘻 | 名簿 | | 概要 | |
| 12 | 外胚葉形成不全免疫不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 13 | 褐色細胞腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 14 | 肝型糖原病 | 名簿 | | 概要 | |
| 15 | 急性大動脈症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 16 | 筋強直性ジストロフィー | 名簿 | | 概要 | |
| 17 | 筋チャネル病 | 名簿 | | 概要 | |
| 18 | 劇症1型糖尿病 | 名簿 | | 概要 | |
| 19 | 血管新生黄斑症 | 名簿 | | 概要 | |
| 20 | 血球貪食症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 21 | 原発性リンパ浮腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 22 | 高グリシン血症 | 名簿 | | 概要 | |
| 23 | 高チロシン血症 | 名簿 | | Ⅰ型概要 Ⅱ型概要 Ⅲ型概要 | |
| 24 | 高プロリン血症 | 名簿 | | 概要 | |
| 25 | 高IgD症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 26 | 好酸球性食道炎・好酸球性胃腸炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 27 | 甲状腺中毒クリーゼ | 名簿 | | 概要 | |
| 28 | 後天性血友病ⅩⅢ | 名簿 | | 概要 | |
| 29 | 骨形成不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 30 | 鰓弓耳腎(BOR)症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 31 | 再発性多発軟骨炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 32 | 細網異形成症 | 名簿 | | 概要 | |
| 33 | 自己免疫性内耳障害 | 名簿 | | 概要 | |
| 34 | 自己貪食空胞性ミオパチー | 名簿 | | 概要 | |
| 35 | 自発性低血糖症 | 名簿 | | 概要 | |
| 36 | 若年性線維筋痛症 | 名簿 | | 概要 | |
| 37 | 若年性特発性関節炎 (全身型) | 名簿 | | 概要 | |
| 38 | 周産期心筋症 | 名簿 | | 概要 | |
| 39 | 小眼球(症) | 名簿 | | 概要 | |
| 40 | 小児交互性片麻痺 | 名簿 | | 概要 | |
| 41 | 新生児バセドウ病 | 名簿 | | 概要 | |
| 42 | 新生児ループス | 名簿 | | 概要 | |
| 43 | 新生児一過性糖尿病(TNDM) | 名簿 | | 概要 | |
| 44 | 新生児及び乳幼児の肝血管腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 45 | 新生児食物蛋白誘発胃腸炎様疾患(N-FPIES) | 名簿 | | 概要 | |
| 46 | 新生児糖尿病 | 名簿 | | 概要 | |
| 47 | 深部静脈血栓症 | 名簿 | | 概要 | |
| 48 | 進行性下顎頭吸収(PCR) | 名簿 | | 概要 | |
| 49 | 進行性心臓伝導障害(CCD) | 名簿 | | 概要 | |
| 50 | 腎性尿崩症 | 名簿 | | 概要 | |
| 51 | 瀬川病 | 名簿 | | 概要 | |
| 52 | 性分化異常症 | 名簿 | | 概要 | |
| 53 | 成人型分類不能型免疫不全症(CVID) | 名簿 | | 概要 | |
| 54 | 声帯溝症 | 名簿 | | 概要 | |
| 55 | 脆弱X症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 56 | 脊髄障害性疼痛症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 57 | 脊柱変形に合併した胸郭不全症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 58 | 先天性角化不全症(DC) | 名簿 | | 概要 | |
| 59 | 先天性角膜混濁 | 名簿 | | 概要 | |
| 60 | 先天性高インスリン血症 | 名簿 | | 概要 | |
| 61 | 先天性赤芽球癆 (Diamond Blackfan貧血) | 名簿 | | 概要 | |
| 62 | 先天性大脳白質形成不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 63 | 先天性ビオチン代謝異常症 | 名簿 | | 概要 | |
| 64 | 先天性無痛症(HSAN4型、5型) | 名簿 | | 概要 | |
| 65 | 先天性両側小耳症・外耳道閉鎖疾患 | 名簿 | | 概要 | |
| 66 | 先天白内障 | 名簿 | | 概要 | |
| 67 | 胎児仙尾部奇形腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 68 | 多発性内分泌腫瘍症 | 名簿 | | 概要 | |
| 69 | 単純性潰瘍/非特異性多発性小腸潰瘍 | 名簿 | | 概要 | |
| 70 | 胆道閉鎖症 | 名簿 | | 概要 | |
| 71 | 中性脂肪蓄積心筋血管症 | 名簿 | | 概要 | |
| 72 | 長鎖脂肪酸代謝異常症 | 名簿 | | 概要 | |
| 73 | 低ホスファターゼ症 | 名簿 | | 概要 | |
| 74 | 道化師様魚鱗癬 | 名簿 | | 概要 | |
| 75 | 特発性局所多汗症 | 名簿 | | 概要 | |
| 76 | 特発性耳石器障害 | 名簿 | | 概要 | |
| 77 | 内臓錯位症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 78 | 中條-西村症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 79 | 那須ハコラ病 | 名簿 | | 概要 | |
| 80 | 軟骨異栄養症 | 名簿 | | 概要 | |
| 81 | 軟骨無形成症 | 名簿 | | 概要 | |
| 82 | 難治性川崎病 | 名簿 | | 概要 | |
| 83 | 難治性血管腫・血管奇形(混合血管奇形など) | 名簿 | | 概要 | |
| 84 | 難治性脳形成障害症 | 名簿 | | 概要 | |
| 85 | 難治性発作性気道閉塞疾患(PROD:Paroxysmal respiratory obstructive diseases) | 名簿 | | 概要 | |
| 86 | 難治性慢性好酸球性肺炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 87 | 難治性慢性痒疹・皮膚掻痒症 | 名簿 | | 概要 | |
| 88 | 乳児ランゲルハンス組織球症 | 名簿 | | 概要 | |
| 89 | 尿素サイクル異常症 | 名簿 | | 概要 | |
| 90 | 年齢依存性てんかん性脳症 | 名簿 | | 概要 | |
| 91 | 肺血栓塞栓症 | 名簿 | | 概要 | |
| 92 | 肺胞蛋白症 | 名簿 | | 概要 | |
| 93 | 破局てんかん | 名簿 | | 概要 | |
| 94 | 白斑 | 名簿 | | 概要 | |
| 95 | 反復胞状奇胎 | 名簿 | | 概要 | |
| 96 | 非ウイルス性鬱血性肝硬変 | 名簿 | | 概要 | |
| 97 | 肥大性皮膚骨膜症 | 名簿 | | 概要 | |
| 98 | 非もやもや病小児閉塞性脳血管障害 | 名簿 | | 概要 | |
| 99 | 封入体筋炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 100 | 芳香族アミノ酸脱炭酸酵素(AADC)欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 101 | 発作性運動誘発性舞踏アテトーゼ(PKC) | 名簿 | | 概要 | |
| 102 | 慢性活動性EBウイルス感染症 | 名簿 | | 概要 | |
| 103 | 慢性偽性腸閉塞症 | 名簿 | | 概要 | |
| 104 | 慢性好中球減少症(周期性好中球減少症、慢性本態性好中球減少症、自己免疫性好中球減少症など) | 名簿 | | 概要 | |
| 105 | 慢性動脈周囲炎(Chronic Periaortitis: CP) | 名簿 | | 概要 | |
| 106 | 未熟児網膜症 | 名簿 | | 概要 | |
| 107 | 牟婁病(紀伊ALS/PDC) | 名簿 | | 概要 | |
| 108 | 毛細血管拡張性小脳失調症(AT) | 名簿 | | 概要 | |
| 109 | 優性遺伝形式を取る遺伝性難聴 | 名簿 | | 概要 | |
| 110 | 両側性蝸牛神経形成不全症 | 名簿 | | 概要 | |
| 111 | アイカルディ・ゴーティエ症候群(AGS) | 名簿 | | 概要 | |
| 112 | アトピー性脊髄炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 113 | アラジール(Alagille)症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 114 | アレキサンダー病 | 名簿 | | 概要 | |
| 115 | アンジェルマン症候群(AS) | 名簿 名簿 | | 概要 | |
| 116 | ウエルナー(Werner)症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 117 | ウォルフヒルシュホーン症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 118 | エーラスダンロス症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 119 | エマヌエル症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 120 | オルニチントランスカルバミラーゼ欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 121 | カナバン病 | 名簿 | | 概要 | |
| 122 | カルバミルリン酸合成酵素欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 123 | キャンポメリック ディスプラジア | 名簿 | | 概要 | |
| 124 | クラインフェルター症候群(KS) | 名簿 | | 概要 | |
| 125 | コケイン症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 126 | コステロ症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 127 | コハク酸セミアルデヒド脱水素酵素欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 128 | コレステリルエステル転送蛋白 (CETP)欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 129 | サクシニル-CoA:3-ケト酸CoAトランスフェラーゼ欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 130 | サラセミア | 名簿 | | 概要 | |
| 131 | ジストニア | 名簿 | | 概要 | |
| 132 | シトリン欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 133 | シャルコー・マリー・トゥース病 | 名簿 | | 概要 | |
| 134 | スミスマゲニス症候群(SMS) | 名簿 | | 概要 | |
| 135 | セピアプテリン還元酵素欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 136 | ソトス症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 137 | ターナー症候群(TS) | 名簿 | | 概要 | |
| 138 | チトクロームP450オキシドレダクターゼ異常症 | 名簿 | | 概要 | |
| 139 | チロシン水酸化酵素欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 140 | ビッカースタッフ型脳幹脳炎 | 名簿 | | 概要 | |
| 141 | フェニルケトン尿症 | 名簿 | | 概要 | |
| 142 | フックス角膜内皮変性症 | 名簿 | | 概要 | |
| 143 | プラダー・ウイリー症候群(PWS) | 名簿 名簿 | | 概要 | |
| 144 | プロピオン酸血症 | 名簿 名簿 | | 概要 | |
| 145 | マルファン症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 146 | ミクリッツ病 | 名簿 | | 概要 | |
| 147 | メチルマロン酸血症 | 名簿 名簿 | | 概要 | |
| 148 | リンパ管腫 | 名簿 | | 概要 | |
| 149 | ロイス・デイーツ症候群(LDS) | 名簿 | | 概要 | |
| 150 | AAA症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 151 | ATR-X(X連鎖αサラセミア・精神遅滞)症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 152 | Beckwith-Wiedemann症候群(BWS) | 名簿 名簿 | | 概要 | |
| 153 | Brugada症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 154 | Calciphylaxis | 名簿 | | 概要 | |
| 155 | Cavinopathy(リポジストロフィーとミオパチーを合併する新規遺伝性疾患) | 名簿 | | 概要 | |
| 156 | CFC症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 157 | CHARGE症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 158 | CINCA症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 159 | CNP/GC-B系異常による新規骨系統疾患 | 名簿 | | 概要 | |
| 160 | Congenital dyserythropoietic anemia (CDA) | 名簿 | | 概要 | |
| 161 | Gorlin症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 162 | IgG4関連全身硬化性疾患 | 名簿 | | 概要 | |
| 163 | IgG4関連多臓器リンパ増殖性疾患(MOLPS) | 名簿 | | 概要 | |
| 164 | Landau-Kleffner症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 165 | Microscopic colitis | 名簿 | | 概要 | |
| 166 | Mowat-Wilson症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 167 | Muckle-Wells症候群(MWS) | 名簿 | | 概要 | |
| 168 | Pelizaeus-Merzbacher病 | 名簿 | | 概要 | |
| 169 | Pendred症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 170 | Rett症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 171 | RS3PE症候群(remitting seronegative symmetrical synovitis with pitting edema) | 名簿 | | 概要 | |
| 172 | Rubinstein-Taybi症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 173 | Silver-Russell症候群(SRS) | 名簿 | | 概要 | |
| 174 | von Hippel-Lindau 病 | 名簿 | | 概要 | |
| 175 | Wolfram症候群 | 名簿 | | 概要 | |
| 176 | β-ケトチオラーゼ欠損症 | 名簿 | | 概要 | |
| 177 | 14番染色体父性片親性ダイソミー(upd(14)pat)関連疾患 | 名簿 | | 概要 | |